Die ersten verlässlichen Erwähnungen des Borisoglebsk-Klosters finden sich in den Nikonschen und der vierten Novgoroder Chronik und stammen aus der ersten Hälfte des 14. Jahrhunderts. In der Wladimirer Chronik von 1346 heißt es: „Im selben Jahr starb Fürst Wasilij Jaroslawitsch von Murom, in der Kirche und im Kloster wurde er in Murom, in der Kirche des heiligen Märtyrers Boris und Gleb, beigesetzt.“ Die Nikonsche Chronik fügt hinzu: „im Kloster auf Ushin, unter dem Metropoliten Theognost.“ Die vierte Novgoroder Chronik präzisiert, dass Fürst Wasilij Jaroslawitsch im Winter des Jahres 6853 starb, also Ende 1345.

Lange Zeit blieb das Kloster aus Holz, und erst im 17. Jahrhundert wurden anstelle der alten Holzbauten neue steinerne Kirchen errichtet: zu Ehren der Himmelfahrt des Herrn mit einer Kapelle der Märtyrer Boris und Gleb sowie zu Ehren der Geburt Christi und der Ikone der Gottesmutter von Kasan. Das genaue Datum ihres Baus ist unbekannt, aber aus einer Inschrift auf dem erhaltenen Antimens lässt sich schließen, dass der Altar der Kapelle im Namen der Märtyrer Boris und Gleb im Jahr 1681 geweiht wurde. In den Aufzeichnungen des Rjasaner Bistums aus dem Jahr 1676, zu dem damals auch der Muromski Bezirk gehörte, wird in dem Borisoglebsk-Kloster die Kirche der Märtyrer Boris und Gleb erwähnt. „Bei dieser Kirche gibt es den Hof des Priesters Michail, des Diakons Zotik, des Diakons Stepan, in der Gemeinde 5 Diensthöfe, 59 Bauernhöfe und 19 Bäuerchen; das Dorf Blagoweschenskoje, darin 30 Bauernhöfe; das Dorf Pentsy, 6 Bauernhöfe und das Dorf Warezh, darin 32 Bauernhöfe und 7 Bäuerchen.“ Das Kloster war von einer steinernen Mauer umgeben.

Im Jahr 1992 wurde die Kirche der Geburt Christi des ehemaligen Borisoglebsk-Klosters der Russischen Orthodoxen Kirche zurückgegeben und wurde zur Filialgemeinde des Heiligen Blagoweschenskoje Männlichen Klosters in der Stadt Murom. Im Jahr 2013, mit der Segnung des Bischofs von Murom und Vyazniki, Nila, wurde die Kirche der Geburt Christi zur Bischöflichen Filialgemeinde. Das Klosterleben wurde wieder aufgenommen, und die Gottesdienste wurden regelmäßig. Jetzt finden auf dem Gelände des Klosters ständig Gottesdienste in der Kirche der Geburt Christi im ersten Stock statt. Im zweiten Stock befindet sich die Kirche zu Ehren der Ikone der Gottesmutter von Kasan. Bei der Filialgemeinde wurde das Pilgerzentrum „Eudokia“ eröffnet, benannt nach der Tochter der Heiligen Peter und Fevronia von Murom, mit Platz für 80 Personen. Hier gibt es auch eine Kantine, ein Museum „Russische Tracht und Lebensweise“, eine Bibliothek, eine Quelle und ein Taufbecken sowie eine klösterliche Wirtschaft.