Im Isaakow-Kloster befindet sich eine steinerne und robuste Kirche. Ihre Vorderseite ist kalt und hat einen Altar, der 1758 zu Ehren der Geburt der heiligen Gottesmutter geweiht wurde. Das Fest dieser Kirche wird am 8. September gefeiert. Der hintere Teil der Kirche ist warm und umfasst zwei Altäre: einen zu Ehren der Geburt des heiligen Johannes des Täufers und einen des heiligen Nikolaus von Myra. Diese Altäre werden am 24. Juni, 9. Mai und 6. Dezember gefeiert. Auch der 25. November wird als Tag der Erscheinung des wundertätigen Isaakow-Ikone der Geburt der heiligen Gottesmutter gefeiert. Die Hauptreliquie des Klosters ist diese Ikone, die 1659 zu Ehren ihres Erscheinens im Dorf Isaakowo benannt wurde.