Im Jahr 1885 wurde im Diveevski-Kloster das Igumen-Gebäude errichtet, das von Batjuschka als das Verwaltungsgebäude bezeichnet wurde. Es wurde an dem Ort errichtet, der auf dem Plan angegeben war, der von dem heiligen Seraphim erstellt und im Kloster aufbewahrt wird. In dem Gebäude befanden sich die Bischofsräume, die Zellen der Äbtissin, die Kasse, das Büro, die Bibliothek und Räume zur Herstellung von Kunstblumen.

Im Jahr 1902 wurde für die kranke Äbtissin Maria Ushakova im östlichen Teil des Gebäudes eine Hauskapelle eingerichtet, die bis zu 50 Personen Platz bot. Die Kirche wurde zu Ehren der heiligen gleichapostolischen Maria Magdalena, der himmlischen Schutzpatronin der Äbtissin, geweiht.

Im Jahr 1903 waren bei der Liturgie in dieser Kirche Kaiser Nikolaus II., die Kaiserin und Mitglieder des Kaiserhauses anwesend, die das Diveevski-Kloster nach der Heiligsprechung des heiligen Seraphim in Sarow besuchten. Dieses Ereignis wurde zu einem wichtigen Meilenstein in der Geschichte des Klosters. Zum Gedenken daran wurde im neu gestalteten Kirchenikonostase ein Ikone der königlichen Märtyrer platziert.

Nach der Schließung des Klosters wurde die Kirche verwüstet. Im Igumen-Gebäude wurden zunächst das Diveevski-Waisenhaus und später verschiedene Einrichtungen und Wohnungen untergebracht.

Im Sommer 1996 wurde die Fassade renoviert und die Kuppel über der Hauskapelle zu Ehren der heiligen Maria Magdalena wiederhergestellt. Am 27. September, am Fest der Erhöhung des Kreuzes des Herrn, wurde ein Kreuz auf die Kuppel gesetzt. Ab 1997 begannen die Arbeiten im Inneren der Kirche. Im Jahr 1996 wurde eine allgemeinbildende orthodoxe Klosterschule eröffnet. Am 26. September 2000 wurden die Reliquien der heiligen Alexandra, Martha und Elena von Diveevo gefunden, und am 22. Dezember wurden sie als lokal verehrte Heilige der Nischni Nowgorod Diözese heiliggesprochen.

Die Kirche wurde am 3. Februar 2006 erneut geweiht.