Im Jahr 1837 baute der lokale Grundbesitzer Michail Jewgrafjewitsch Protopopow im Dorf Dukhivnitskoe ein Gebetshaus mit einer kleinen Kapelle, in der Beerdigungen und die Überführung der Verstorbenen stattfanden.

Nach der Gründung des Samara-Gouvernements im Jahr 1851 wurde das Dorf Dukhivnitskoe kirchlich von der Diözese Saratow in die neu gegründete Diözese Samara umgegliedert. Im April 1856 wandte sich die Witwe des Grundbesitzers, Praskowja Alexandrowna Protopopowa, an die Samara Geistliche Konsistenz mit der Bitte, das Gebetshaus in eine Friedhofskirche im Namen des Erzengels Gottes Michael umzubauen. Es war vorgesehen, dass an Sonntagen und Feiertagen einer der Priester der Pokrowskaja Kirche im Dorf Lipovka die Gottesdienste dort leiten würde. Im Mai 1856 wurde die Genehmigung für den Bau erteilt, und bis November 1857 war die Kirche fertiggestellt. Am 8. November 1857 wurde sie von dem Priester des Dorfes Lipovka, Mark Ostrowidow, geweiht.

Im September 1871 wurde die Kirche im Dorf Dukhivnitskoe in eine Halbkirche umgebaut und blieb in der Gemeinde der Pokrowskaja Kirche im Dorf Lipovka. Im April 1894 wurde die Michael-Archangel-Kirche erneut umgebaut und erweitert. Der Erweiterungsplan wurde am 29. April 1894 von der Bauabteilung der samara Gouvernementsverwaltung genehmigt. Die Arbeiten wurden unter der Aufsicht des Diözesanarchitekten Chilin durchgeführt. Die erneuerte Kirche bot Platz für bis zu 400 Gläubige und hatte eine Fläche von 20 Quadrat-Saschen. Neben der Kirche wurde ein Wachhaus im Kirchenzaun errichtet. Die Kirche war auf 10.000 Rubel bei der St. Petersburger Versicherungsgesellschaft versichert. Neben der Kirche befand sich ein Friedhof, der von einem Graben umgeben war. Der Kirchenvorstand bestand aus einem Priester und einem Psalmodisten, für die 1892 ein zweigeschossiges Steinhaus gebaut wurde.

Im Jahr 1878 wurde dank der Bemühungen des Adligen A.M. Protopopow, dem Sohn des Kirchenbauers, an der Kirche eine zweiklassige Schule eröffnet. Am 24. September 1895 wurde eine einklassige kirchliche Schule eröffnet, die in dem von der Grundbesitzerin P.A. Protopopowa für sie erbauten Haus untergebracht war.

In den sowjetischen Jahren wurde der Tempel in ein Kino umgebaut, dann in einen Ausbildungsbetrieb für das Landwirtschaftsmanagement, und später an eine Musikschule übergeben.

Am 31. Mai 1995 wurde das Gebäude der Kirche der orthodoxen Gemeinde des Arbeitersiedlung Dukhivnitskoe übergeben. Der Erzbischof von Saratow und Wolsk, Alexander, weihte das Antimens für die Kirche, die nach dem heiligen Propheten Gottes Elias benannt wurde. In der Kirche wurden eine Bibliothek und eine Sonntagsschule eröffnet. Aufgrund der Abnutzung des alten Holzgebäudes war jedoch eine vollständige Restaurierung nicht möglich, weshalb beschlossen wurde, eine neue Kirche auf dem zentralen Platz zu bauen. Diese wurde mit Hilfe von Investoren und Wohltätern in den Jahren 2010 und 2012 nach den erhaltenen Zeichnungen des historischen Gebäudes, jedoch aus Ziegeln, errichtet. Die große Weihe der Kirche fand am 23. Mai 2012 durch den Bischof von Pokrowsk und Nikolajew, Pachomij, statt.