Небольшая усадьба, соседствующая с обширными владениями Г.П. Гагарина, в конце XVIII и начале XIX веков принадлежала Марфе Протковой, жене коллежского асессора. Главный дом усадьбы, деревянный одноэтажный с антресолями на каменном фундаменте, был построен в 1809 году и располагался вдоль Земляного вала.

Уцелевший после пожара 1812 года, дом в 1815 году приобрел ампирные черты, соответствующие времени. Архитектор О.И. Бове украсил его богатой лепниной и массивным тосканским портиком, который выступал вперед, образуя террасу.

Во второй половине XIX века дом перешел в собственность семьи Коншиных: купца и потомственного дворянина Николая Николаевича и его жены Ольги Николаевны, урожденной Добрыниной. У них было много детей, в том числе от первого брака Н. Коншина. В 1881 году владельцы провели капитальный ремонт, частично заменив потолочные балки, венцы и оконные рамы.

В 1897 году на соседнем участке открылась детская Софийская больница. Через год сыновья Коншиных продали ей свои земли. С этого момента ворота усадьбы стали главным въездом в больницу, а деревянный дом стал частью больничных владений и квартирой главного врача. Здесь жили известные врачи Н.В. Яблоков, Е.А. Покровский и Н.Ф. Филатов, чье имя больница получила в 1922 году.

Во время революции 1905 года дом пострадал от артиллерийского обстрела Пресни.

В 1985 году началась реставрация дома, которая с перерывами продолжалась несколько десятилетий. Особое внимание уделялось восстановлению уникальных интерьеров. Сохранилась первоначальная анфиладная планировка, частичная лепнина потолков, старинные изразцовые печи и колонны. Благодаря кропотливой работе реставраторов удалось воссоздать первоначальное убранство: зеленую, малиновую и золотисто-охристую гостиные, дубовую лестницу и великолепную лепнину. В отреставрированном доме Филатовская больница планирует открыть музей.