Село Домнино, находящееся в современном Сусанинском районе, имеет значительное историческое значение для России как вотчина Ксении Ивановны Шестовой, матери первого царя из династии Романовых Михаила Феодоровича. В конце 1612 года здесь совершил свой известный подвиг крестьянин Иван Сусанин, и, по мнению некоторых историков, его останки могли быть захоронены в подклете деревянного Воскресенского храма, который стоял на этом месте.

В период с 1810 по 1817 годы рядом со старым Воскресенским храмом, на месте дома инокини Марфы, была построена каменная Успенская церковь с приделами, посвященными святителю Николаю и Тихвинской иконе Божией Матери, которые добавили в 1827 году. Деревянный храм, окончательно обветшавший, разобрали в 1831 году.

В 1879 году в Костроме было основано Александровское православное братство, которое занималось благотворительной и просветительской деятельностью в местах, связанных с историей дома Романовых. В 1893 году братство построило в Домнино двухэтажное каменное здание церковно-приходской школы, а в 1913 году воздвигло часовню в честь Ивана Сусанина в деревне Деревеньки.

В ХХ веке Успенский храм в Домнино продолжал функционировать, закрывшись лишь с 1937 по 1944 год. С 1991 года храм стал подворьем Богоявленско-Анастасииного женского монастыря, и в здании бывшей церковно-приходской школы, переданном Костромской епархии, поселились сестры этой обители.

Согласно решению Священного Синода Русской Православной Церкви от 25 марта 2004 года, в Домнино был открыт женский монастырь во имя святых Царственных страстотерпцев: царя Николая, царицы Александры, царевича Алексия, великих княжен Ольги, Татианы, Марии и Анастасии.

К монастырю относится часовня в честь Усекновения главы Иоанна Предтечи, расположенная в деревне Деревеньки. В обители также действует небольшая богадельня.