Первый этаж музея используется для проведения выставок. Здесь можно увидеть экспозиции из ведущих мировых музеев, персональные выставки современных художников и работы из собственной коллекции музея. На втором этаже представлены постоянные экспозиции, такие как «Современное искусство Кореи», «Декоративно-прикладное искусство Японии» и «Русское искусство XIX, начала XX веков».

Сотрудники музея активно занимаются научно-исследовательской деятельностью, выпустив более 50 научных статей, каталогов и монографий. Музей также проводит обширную научно-просветительскую работу, включая экскурсии, лекции и занятия с использованием экспонатов из своих фондов. Особой популярностью пользуется церемония «Русское чаепитие», организуемая для жителей и гостей Сахалинской области. Более 15 лет в музее действует «Школа восприятия» для детей в возрасте от 3 до 6 лет.

Музей был основан в 1983 году по распоряжению Министерства культуры РСФСР, а его экспозиции открылись 25 марта 1989 года.

В настоящее время коллекция музея насчитывает около 11 500 единиц хранения.

Формирование музейного фонда происходило из различных источников, включая Государственный музейно-выставочный фонд «Росизо», Российский фонд культуры, Научно-исследовательский институт художественной промышленности, Государственный Русский музей и союзы художников бывших советских республик, таких как Украина, Киргизия, Грузия и Латвия. Значительная часть коллекции русского искусства XIX, начала XX веков поступила из художественных салонов Москвы и Санкт-Петербурга, а также из частных коллекций.

Музей находится в здании, ранее принадлежавшем Японскому банку «Хоккайдо Такусёку», построенном в 1930 году неизвестным японским архитектором в стиле позднего модерна. В середине 1980-х годов здание было реконструировано и передано музею Сахалинским отделением Государственного Банка СССР. Это здание, расположенное в центре Южно-Сахалинска, является уникальным историко-архитектурным памятником Сахалинской области.