Свято-Успенская Вышенская пустынь расположена в Рязанской области на правом берегу реки Выши, недалеко от ее впадения в Цну. Ближайшие к монастырю деревни, Выша и Важное.

Обитель была основана на этом месте в 1625 году. Долгое время она оставалась малоизвестной на Руси. Монастырь, находившийся в удаленных местах, служил форпостом для распространения христианства среди местных язычников, мордвы.

Изначально Вышенская Успенская пустынь располагалась на левом берегу реки Выши, что создавало угрозу затопления весной. Монахи обратились к Михаилу Фёдоровичу с просьбой о новом месте, и Марфа Иоанновна выдала грамоту, указав новое, нынешнее местоположение.

Основателем и первым строителем обители был игумен Тихон, который руководил монастырем 36 лет, с 1625 по 1661 год. О его происхождении и пути в монашество ничего не известно.

Первый храм, Успенский, был построен только в 1762 году, а колокольня, в 1818 году. Затем появились Казанский собор в 1844 году, Богоявленская церковь в 1867 году и Христорождественский собор в 1890 году.

Со временем Вышенская обитель стала центром духовного просвещения в регионе.

История монастыря знала сложные времена. Из-за бедности и малочисленности братии в декабре 1724 года пустынь была закрыта и приписана к Чернееву монастырю. Предположительно, через два года она была вновь открыта.

В 1800 году Шацкий уезд перешел к Тамбовской губернии. Епископ Тамбовский Феофил назначил настоятелем старца из Саровской пустыни Тихона, который успешно возродил обитель как в экономическом, так и в духовном плане.

В 1827 году монахиня Миропия (Данкова) подарила монастырю чудотворный Казанский образ Божией Матери. После явления чудес от этой иконы, особенно во время эпидемии холеры в Тамбовском крае, известность обители возросла. Тогда начались крестные ходы с иконой по городам и селам губернии.

Обитель приобрела еще большую известность в 1862 и 1907 годах при архимандрите Аркадии (Честонове). Аркадий, происходивший из бедной семьи, стремился распространить просвещение среди простого народа. В этот период в пустынь поселился святитель Феофан (Говоров), который активно трудился на благо Церкви, занимаясь переводами и толкованиями святоотеческой литературы и Священного Писания. О монастыре он писал: «Вышу можно променять только на Царство Небесное». Первые шесть лет в обители святитель не уединялся полностью, но с Великого Поста 1873 года начал затворническую жизнь. В одной из келий была устроена церковь во имя Богоявления, где святитель служил ежедневно. В это время Вышенская пустынь достигла расцвета и стала центром духовного просвещения не только Шацкой земли, но и всей России.

После революции монастырь не закрыли сразу. Вначале там разместили «Детский городок III Интернационала», чтобы вытеснить монашескую общину и использовать храмы для своих нужд. Впоследствии в обители находились детский сад, лесхоз, свиносовхоз, психиатрическая «колония» и, наконец, областная психиатрическая больница. Храмы и здания монастыря пришли в упадок.

29 апреля 1990 года было принято решение о передаче некоторых зданий бывшей Успенской Вышенской пустыни Рязанскому епархиальному управлению. Монастырь решили открыть как женский. На следующий день, 30 апреля, в Борисоглебском соборе Рязани архиепископ Рязанский и Касимовский Симон посвятил монахиню Нонну (Знаменскую) в сан игумении и назначил ее настоятельницей.

29 июня 2002 года состоялось торжественное перенесение мощей святителя Феофана Затворника из села Эммануиловка в Успенский храм Вышенской пустыни.

14 марта 2009 года архиепископ Рязанский и Касимовский Павел освятил Казанский собор. Перед этим в собор были перенесены мощи святителя Феофана из Успенского храма. Чудотворная Казанская Вышенская икона Божией Матери также теперь находится в обители.