La Sainte-Pustynie de Vychensky est située dans la région de Riazan, sur la rive droite de la rivière Vychy, près de son confluent avec la Tsna. Les villages les plus proches du monastère sont Vychy et Vazhnoe.

Le monastère a été fondé à cet endroit en 1625. Pendant longtemps, il est resté peu connu en Russie. Le monastère, situé dans des lieux isolés, servait de poste avancé pour la diffusion du christianisme parmi les païens locaux, les Mordves.

À l'origine, la Sainte-Pustynie de Vychensky était située sur la rive gauche de la rivière Vychy, ce qui créait un risque d'inondation au printemps. Les moines se sont adressés à Mikhaïl Fiodorovitch pour demander un nouvel emplacement, et Marfa Ioannovna a délivré un acte indiquant le nouvel emplacement actuel.

Le fondateur et premier constructeur de la communauté était l'igoumène Tikhon, qui a dirigé le monastère pendant 36 ans, de 1625 à 1661. On ne sait rien de ses origines et de son chemin vers la vie monastique.

Le premier temple, l'Assomption, n'a été construit qu'en 1762, et le clocher, en 1818. Ensuite, la cathédrale de Kazan a été érigée en 1844, l'église de l'Épiphanie en 1867 et la cathédrale de la Nativité du Christ en 1890.

Avec le temps, la communauté de Vychensky est devenue un centre d'enseignement spirituel dans la région.

L'histoire du monastère a connu des périodes difficiles. En raison de la pauvreté et du faible nombre de frères, en décembre 1724, la pustynie a été fermée et rattachée au monastère de Tcherneev. On suppose qu'elle a été rouverte deux ans plus tard.

En 1800, le district de Shatsky a été transféré à la province de Tambov. L'évêque de Tambov, Théophile, a nommé comme supérieur un ancien du monastère de Sarov, Tikhon, qui a réussi à revitaliser la communauté tant sur le plan économique que spirituel.

En 1827, la moniale Mirovia (Dankova) a offert au monastère une icône miraculeuse de la Mère de Dieu de Kazan. Après les miracles associés à cette icône, en particulier pendant l'épidémie de choléra dans la région de Tambov, la renommée de la communauté a augmenté. Des processions avec l'icône ont alors commencé à travers les villes et les villages de la province.

La communauté a acquis une renommée encore plus grande en 1862 et 1907 sous l'archimandrite Arkadi (Chestnov). Arkadi, issu d'une famille pauvre, cherchait à répandre l'éducation parmi le peuple simple. À cette époque, le saint Théophane (Govorov) s'est installé dans la pustynie, travaillant activement pour le bien de l'Église, s'occupant de traductions et d'interprétations de la littérature patristique et des Écritures. Il a écrit sur le monastère : « On ne peut échanger Vychy que contre le Royaume des Cieux ». Pendant les six premières années dans la communauté, le saint ne s'est pas complètement isolé, mais à partir du Grand Carême de 1873, il a commencé une vie d'ermite. Dans l'une des cellules, une église a été aménagée au nom de l'Épiphanie, où le saint célébrait quotidiennement. À cette époque, la Sainte-Pustynie de Vychensky a atteint son apogée et est devenue un centre d'enseignement spirituel non seulement pour la terre de Shatsk, mais pour toute la Russie.

Après la révolution, le monastère n'a pas été fermé immédiatement. Au début, il a été transformé en « Ville d'enfants du IIIe Internationale », afin d'évincer la communauté monastique et d'utiliser les temples pour ses propres besoins. Par la suite, la communauté a abrité une crèche, une exploitation forestière, un élevage de porcs, une « colonie » psychiatrique et, enfin, un hôpital psychiatrique régional. Les temples et les bâtiments du monastère ont été laissés à l'abandon.

Le 29 avril 1990, il a été décidé de transférer certains bâtiments de l'ancienne Sainte-Pustynie de Vychensky à l'administration diocésaine de Riazan. Le monastère a été décidé d'ouvrir comme féminin. Le lendemain, le 30 avril, dans la cathédrale de Borisoglebsk à Riazan, l'archevêque de Riazan et de Kasimov, Simon, a consacré la moniale Nonna (Znamenka) au rang d'iguménie et l'a nommée supérieure.

Le 29 juin 2002, la translation solennelle des reliques du saint Théophane le Reclus a eu lieu du village d'Emmanuilovka à l'église de l'Assomption de la Sainte-Pustynie de Vychensky.

Le 14 mars 2009, l'archevêque de Riazan et de Kasimov, Pavel, a consacré la cathédrale de Kazan. Avant cela, les reliques du saint Théophane ont été transférées de l'église de l'Assomption. L'icône miraculeuse de la Mère de Dieu de Kazan de Vychensky se trouve également maintenant dans la communauté.