Первые признаки создания обители можно отнести к середине 1980-х годов. С 1982 года настоятелем Ермолинского прихода Воскресения Словущего, где было не более 20 постоянных прихожан, служил игумен Антоний Логинов, который сейчас является духовником монастыря. В 1994 году, по благословению архиепископа Амвросия, при храме Воскресения Словущего в Ермолино была зарегистрирована монашеская община, и это место стало называться Ермолинской пустынью. В общину, помимо игумена Антония, входили еще трое священнослужителей: иеромонах Варлаам Борин, иерей Андрей Львов и иеродиакон Иларион Соколовский.

По ходатайству архиепископа Амвросия, Святейший Патриарх Алексий II и Святейший Синод в апреле 1998 года утвердили создание Свято-Воскресенского мужского монастыря в Ермолинской пустыни.

Монастырю принадлежит братский корпус, построенный в 2003 году. Это большое трехэтажное каменное здание с кельями для монахов. На первом этаже находятся библиотека и просфорня.