Храмовый комплекс в поселке Прохоровка был создан в память о Прохоровском танковом сражении и в честь 50-летия Победы в Великой Отечественной войне. Это генеральное сражение произошло 12 июля 1943 года, в день, когда Церковь отмечает память святых апостолов Петра и Павла, поэтому храм-памятник освящен в их честь.

Закладной камень освятил 14 июня 1992 года архиепископ Курский и Белгородский Ювеналий. 23 ноября 1993 года был создан попечительский совет «Прохоровское поле» для поддержки строительства мемориального комплекса. Главным архитектором проекта стал Д.С. Соколов, главным инженером, Е.Н. Попов, а главным конструктором, С.А. Белов из Архитектурно-художественных мастерских Данилова монастыря. В храме на белых мраморных плитах золотыми буквами высечены имена восьми с половиной тысяч воинов, павших под Прохоровкой. Освящение храма провел Святейший Патриарх Московский и всея Руси Алексий II 3 мая 1995 года. В 2000 году завершилась роспись храма, выполненная в течение полутора лет бригадой иконописцев под руководством А.С. Работнова, члена Союза художников России.

В состав храмового комплекса входит также ротонда с Колоколом Единения, возведенная по инициативе архиепископа Белгородского и Старооскольского Иоанна и губернатора Белгородской области Е.С. Савченко. На каждом пилоне ротонды изображены святые, особо почитаемые тремя славянскими народами: святой равноапостольный великий князь Владимир, Преподобный Сергий Радонежский и преподобная Евфросиния Полоцкая. Колокол был отлит в Москве, и на его верхнем поясе начертаны слова Преподобного Сергия Радонежского: «Любовию и единением спасемся». 3 мая 2000 года, после Божественной литургии в храме святых апостолов Петра и Павла, Колокол Единения славянских народов освятил Святейший Патриарх Московский и всея Руси Алексий II в присутствии президентов России, Украины и Белоруссии.