Строительство крупного кирпичного Покровского собора началось в 1903 году и завершилось в 1911-1912 годах.

Старожилы рассказывают, что кирпич для строительства монастыря доставляли из деревни Покровка, где находились обжиговые печи помещика Дурасова Н.Н. Позже такие же печи установили рядом со стройкой, используя местную глину. Для улучшения качества кирпича в глину добавляли куриные яйца и кровь овец, которые покупали у местных жителей. Полы собора были выложены шестигранными керамическими плитками из Харькова. В дальнейшем монастырь развивался и обустраивался в основном благодаря усилиям помещиков Эннатских, чьи могилы затерялись у алтаря собора.

В конце 1917 года монастырский хутор подвергся разграблению. В начале 1920-х годов монастырь был закрыт, имущество реквизировано и расхищено, а обитель преобразована в «трудовую коммуну». Однако до 1924 года церковь продолжала функционировать. Впоследствии в монастырских зданиях размещались склад, колония, школа коммунистической молодежи и школа трактористов, а во время Великой Отечественной войны здесь находился детский дом для эвакуированных детей. В этот период были разрушены малые монастырские церкви. Позднее деревянные келейные корпуса разобрали и перевезли в Федоровку и Дедово для использования в качестве жилых и хозяйственных помещений.

В 2005 году началось восстановление собора. Работы было много: отсутствовали крыша, купола, окна и полы. Почти вся штукатурка за сто лет осыпалась, а оставшаяся отсырела и отваливалась при малейшем прикосновении. От прежнего убранства сохранились лишь две иконы на клиросе, но они обрушились при попытке их обрамления. Летом 2005 года были восстановлены купола собора.

Восстановление этого огромного собора, освященного в честь Покрова Пресвятой Богородицы, удалось завершить только через семь лет. Большую роль в возрождении обители сыграл наместник монастыря архимандрит Николай Чернышов. Собор был заново расписан иконописцем Владимиром Никаноровым с дочерью и сыновьями. Внутреннее убранство собора поражает своей красотой: нежно-голубые стены, изящные узоры лепнины на потолке, настенные росписи, впечатляющий своими размерами купол, нарядный иконостас, позолоченные вензеля и лампады. Была проделана огромная работа: например, для создания изящной лепнины на потолках и стенах использовали 25 тонн гипса, который поднимали и укладывали вручную.

Восстановление собора завершилось в 2012 году, когда ему исполнилось 100 лет. Центральный придел собора в честь Покрова Пресвятой Богородицы был освящен 25 сентября 2012 года. Левый придел в честь святой преподобной Зосимы Эннатской освятили 27 июня 2017 года. Правый придел посвящен всем святым, просиявшим в земле Уфимской.

Главной святыней Покровского собора является рака с мощами святой преподобной Зосимы Эннатской. Мощи пребывают в соборе в летний период: от Светлой Пасхи до Покрова Пресвятой Богородицы.