Соборный храм Иоанна Богослова был построен в 1689 году. На первом этаже находился престол в честь святителя Николая Чудотворца, а на верхнем, апостола Иоанна Богослова.

Во второй половине XIX века, благодаря пожертвованиям Д. И. Хлудова, основного благотворителя монастыря, собор полностью перестроили в одноэтажное здание. В нем установили новый иконостас, иконы для которого написал известный рязанский художник Н. В. Шумов. Храм был вновь освящен в честь апостола и евангелиста Иоанна Богослова 5 октября 1862 года.

Рядом находился храм в честь Успения Пресвятой Богородицы, также построенный в 1689 году. Однако в 1868 году его разобрали из-за ветхости. В 1868, 1870 годах на средства Д. И. Хлудова возвели новое здание Успенского собора с тремя престолами. Главный престол был посвящен Успению Божией Матери, правый, «Тихвинской» иконе Божией Матери и преподобному Давиду Солунскому, небесному покровителю Давида Ивановича Хлудова, а левый, святителю Николаю Чудотворцу. Колокольня стала украшением обители.

20 мая 1989 года был освящен соборный храм во имя святого апостола и евангелиста Иоанна Богослова, что стало началом новой истории возрождения монастыря.

1 августа 1993 года под алтарем Иоанно-Богословского собора был устроен и освящен новый храм в честь преподобного Серафима Саровского, священномученика Иувеналия, архиепископа Рязанского, и всех новомучеников и исповедников российских. В этом храме покоятся останки трех последних настоятелей обители, найденные в 1992 году, и устроена братская костница, а также здесь погребен архимандрит Авель Македонов, скончавшийся в 2006 году.