Теплый храм был изначально возведен в 1698 году Иваном Андреевым и посвящен святителю Алексию, митрополиту Московскому. В 1734 году к храму добавили придел с южной стороны, посвященный трем Святителям: Василию Великому, Григорию Богослову и Иоанну Златоусту.

В 1863-1864 годах храм был перестроен и стал трехпрестольным. Главный престол был освящен в честь Иверской иконы Божьей Матери, правый придел, в честь святителя Алексия, митрополита Московского, а левый придел на тот момент еще не был освящен.

5 января 2017 года в Ульяновске состоялось освящение храма Иверской иконы Божией Матери на территории возрождающегося Спасского монастыря. Чин освящения провел митрополит Симбирский и Новоспасский Анастасий.

Возрождение Спасского монастыря является одним из крупнейших проектов по восстановлению разрушенных и строительству новых храмов в регионе, инициированным Сергеем Морозовым совместно с Симбирской митрополией РПЦ.

Восстановление Новодевичьего монастыря началось в 2015 году, когда РПЦ передали одно из четырех сохранившихся монастырских зданий в Пожарном переулке. Инициативу по возрождению монастыря взял на себя известный бизнесмен и меценат Игорь Любченков. Вместе с соратниками они быстро восстановили и фактически заново построили внутреннюю часть здания, где ранее размещались различные ведомства МВД. Сейчас в этом корпусе женской обители находится домовый храм в честь Иверской иконы Божией Матери.