Магдала считается местом, где родилась святая Мария, ученица Христа и мироносица. Подворье находится в Галилее, на западном берегу Тивериадского озера, в районе горы Арбель.

На территории подворья расположен большой сад с грейпфрутовыми деревьями и природные источники с целебной водой: теплый родоновый, «Глазной» и источник, у которого, согласно преданию, Иисус Христос исцелил Марию Магдалину.

Место рождения Марии Магдалины стало объектом паломничества еще в средние века, начиная с Византийской империи. Здесь была построена церковь, которая позже была разрушена, предположительно, сарацинами. При крестоносцах церковь была восстановлена, о чем упоминает русский игумен Даниил.

В 1908 году архимандрит Леонид (Сенцов) приобрел большой участок земли на побережье Галилейского моря с источником святой Марии Магдалины. Архимандрит Леонид отмечал, что «близ Тиверии вновь приобретен большой участок на берегу Тивериадского озера с минеральными источниками, где рассаживается апельсиновый сад и предполагается выстроить храм и барак для поклонников. Это место представляет собой чудный оазис на пустынных берегах озера».

Первая мировая война помешала строительству храма во имя святой Марии Магдалины. На участке в Магдале в одном из домов была устроена временная часовня. В сложные для Русской Духовной Миссии послереволюционные годы часть земли и дом сдавались в аренду. После образования государства Израиль объект перешел в ведение Русской духовной миссии Московского патриархата, и Магдальский сад был обновлен.

В 1962 году при начальнике РДМ архимандрите Никодиме (Ротове) на участке была построена небольшая церковь во имя святой Марии Магдалины. В 1996 году в храме была проведена наружная и внутренняя реставрация. К Пасхе 1997 года стены внутри храма были расписаны фресками в византийском стиле на евангельские темы московским художником Ярославом Добрыниным, связанными с Галилейским морем. В храме также был установлен новый деревянный иконостас.

В июне 1997 года Патриарх Московский и Всея Руси Алексий II заложил здесь первый камень «Дома для паломников», который был построен к 2000-летию христианства. Небольшая гостиница для паломников действует и сегодня. В 1998 году стараниями архимандрита Феодосия (Васнева) на участке в Магдале был построен новый дом для приема паломников.

Подворье является закрытым объектом, и его можно посетить только по благословению и предварительной договоренности. Это сделано для того, чтобы защитить тихую жизнь подворья от зевак, так как оно расположено у дороги, по которой проходят многочисленные экскурсионные туры.