История «Музея реки Обь» начинается в 1982 году, когда в Нефтеюганске был создан первый краеведческий музей на общественных началах. В 2002 году он был преобразован и получил своё современное название.

В музее собраны и изучаются коллекции, охватывающие археологию, декоративно-прикладное искусство, живопись, историю техники, нумизматику, редкие книги, скульптуру и фотографии. Основное внимание уделяется изучению природы и истории бассейна реки Обь, а также культуры, истории и религии людей, живших на этой территории.

В выставочных залах музея представлены четыре постоянные экспозиции. Выставка «Природа реки Обь» включает коллекции, отражающие уникальность флоры и фауны региона. Основные разделы экспозиции: «Хищные птицы», «Промысловые птицы», «Тайга осенью», «Зимняя фауна», «Ондатры», «Околоводные обитатели» и «Рыбы Обского бассейна».

Стационарная выставка «Югорское наследие» рассказывает об истории и этнографии Салымского края (современный Нефтеюганский район) с древнейших времён до наших дней. Этнографический раздел посвящён традиционной культуре коренного населения, салымских и юганских хантов. Также представлены фотографии, сделанные более 100 лет назад в хантыйских юртах участниками экспедиции Тобольского губернского музея.

Выставка «Страницы истории судоходства на Оби» знакомит с развитием водного транспорта, который сыграл важную роль в освоении северных территорий.

Выставка «Русские старожилы Западной Сибири» рассказывает о быте русских переселенцев, демонстрируя предметы их повседневной жизни, такие как самовар и прялка.

К значимым датам и событиям в музее периодически организуются сменные выставки, представляющие разнообразие фондовых коллекций.