Здание, о котором идет речь, напоминает о важных моментах в истории Московского Университета. При его основании М.В. Ломоносовым в 1755 году в состав университета вошел Медицинский факультет. Благодаря своей практической направленности он быстро стал крупнейшим в университете. В 1757 году для университета была приобретена усадьба князя Репнина на Моховой, где сейчас находится Старый Университет. В середине 1780-х годов под руководством М.Ф. Казакова здесь был возведен грандиозный ансамбль Московского Университета, который сильно пострадал в Отечественную войну 1812 года и был восстановлен под руководством Д.И. Жилярди с участием А. Григорьева в стиле московского ампира.

Рост Медицинского факультета привел к тому, что его помещения оказались разбросаны по Москве. В 1884 и 1895 годах под руководством штатного архитектора университета К.М. Быковского на Девичьем поле (Большая Пироговская улица) был построен комплекс Клинического городка (ныне Первый Московский государственный медицинский университет им. И.М. Сеченова). В 1877 году, в преддверии этого строительства, в глубине квартала между улицами Большой Никитской и Тверской, где находится Старый Университет, было возведено новое здание Анатомического корпуса. Автором проекта стал предшественник К.М. Быковского, инженер и архитектор А.А. Никифоров, выпускник Петербургского Строительного института, работавший в Москве и Ярославле.

А.А. Никифоров активно работал в неорусском стиле, особенно в храмовом строительстве. Его наиболее известное сооружение, храм Всех Святых в Ново-Алексеевском монастыре в Красном селе. Новый Анатомический корпус, двухэтажное здание с цоколем, был спроектирован Никифоровым функционально. Фасады украшены рустованными пилястрами, окна обрамлены наличниками. Над входом на северо-восточном фасаде расположен лучковый фронтон. Здание неоднократно меняло свое назначение, и его планировка существенно изменилась с конца XIX до середины XX века. В 2011 году оно было отреставрировано и адаптировано для современного использования.