Монастырь расположен в 3 км к северо-западу от пещеры Махпела, на Западном берегу реки Иордан, в секторе H1, который находится под управлением Палестинской национальной администрации.

В 1868 году архимандрит Антонин (Капустин), возглавлявший Русскую духовную миссию в Иерусалиме, приобрёл участок земли, где рос Мамврийский дуб, найденный им ранее. 22 мая 1871 года у этого дуба впервые была проведена Божественная литургия. В 1874 году неподалёку от этой древней святыни отец Антонин построил каменный двухэтажный дом для паломников. Это место стало популярным среди русских паломников, и вскоре территория, принадлежащая Русской духовной миссии, начала расширяться.

Из-за сложной обстановки в городе, где проживало преимущественно мусульманское население, вопрос о строительстве храма был поднят только в 1904 году архимандритом Леонидом (Сенцовым), руководившим Русской духовной миссией. С 1906 по 1914 год миссия пыталась получить разрешение от турецких властей на строительство и освящение храма. В 1914 году был построен храм Святых праотцев, ставший последним русским храмом на Святой Земле, возведённым до революции 1917 года.

В начале 1920-х годов, после того как связь с Русской Церковью в России была утрачена, участок вместе со всеми постройками и Русской духовной миссией перешёл под управление Русской зарубежной церкви. 31 мая 1925 года монастырский храм был освящён патриархом Иерусалимским Дамианом в честь святых Праотцев. Южный придел был посвящён Пресвятой Троице, а северный, святителю Николаю. Рядом с храмом был построен двухэтажный дом для паломников.

5 июня 1997 года монастырь был передан Московскому патриархату при содействии Ясира Арафата.