Курский Свято-Троицкий женский монастырь, одна из старейших русских обителей, насчитывает более 400 лет истории и является памятником архитектуры федерального значения. Храмовый комплекс монастыря представляет собой значительную художественную ценность как образец русского церковного зодчества XVII-XIX веков, отражая развитие архитектурных стилей трех столетий.

Документальные сведения о времени основания монастыря не сохранились. Однако известно, что в 1623 году Курский Свято-Троицкий девичий монастырь уже существовал. Обитель упоминается и в книге С. Ларионова о древних постройках Курска, изданной в Москве в 1786 году. Автор, ссылаясь на писцовые книги 1628 и 1631 годов, сообщает: «…на посаде за большим старым острогом Девичь монастырь, а на монастыре церковь Живоначальной Троицы с приделом Обновления храма Воскресения Христова, деревянная, келиев в нем 21, монахинь 35; да около монастыря не пашенных ремесленников и бобылей слобода, да пять келиев для убогих; в малом же остроге осадной двор, что купила игумения Сундулея с сестрами на убежище в осадные времена у казака Афанасия Сопина…».

В 1680 году монастырь был уничтожен пожаром, а в 1681 году игумения Пелагия построила деревянную церковь в честь Святой Троицы с приделом в память обновления храма Воскресения Христова. В 1695 году она заложила каменную двухэтажную церковь, сохранившуюся до наших дней.

В 1911 году, при игумении Емилии, в северном приделе Троицкой церкви освятили престол в честь святителя Иоасафа Белгородского и преподобного Серафима Саровского. В том же году, благодаря пожертвованиям курян М.В. и П.Т. Зубковых, был построен новый трехэтажный корпус, где разместилась школа на 100 детей. К этому времени в монастыре было 635 насельниц, 82 из которых подвизались в Александро-Невском скиту, принадлежавшем обители с 1883 года. Скит был устроен при деревне Шуклинка в 7 верстах от Курска на земле, пожертвованной купцом Димитрием Созоновым. Усилиями игумении Софии в 1890 году здесь была построена каменная холодная церковь с колокольней в память избавления Императора Александра III и его семьи от опасности при крушении поезда 17 октября 1888 года на станции Борки. Храм был освящен во имя небесных покровителей царской семьи: святого благоверного князя Александра Невского и святой равноапостольной Марии Магдалины. В 1898 году была построена скитская монашеская богадельня в память коронации Николая II и Александры Федоровны. В 1903 году завершилось строительство теплого храма, освященного в честь святителя Николая Чудотворца, небесного покровителя царя Николая. В 1909 году был устроен колодец благодаря пожертвованиям, особенно Евпраксии Феодоровны Реутовой, чье имя поминалось в синодике монастырского скита. Сейчас жизнь в скиту возрождается, проводятся богослужения в деревянной церкви, восстанавливается каменный храм.

В 1923 году большевики закрыли монастырь, устроив поджог монашеских келий на праздник Успения Пресвятой Богородицы.

С 1923 по 1925 годы в монастыре размещались Музей искусств и историко-археологический кустарный музей.

В 1925 году музеи объединились в Губернский краеведческий музей.

С конца 1920-х годов в монастыре находился Губернский лагерь принудительных работ «ЖАКТ «Воля». В кельях разместили 260 заключенных, были развернуты мастерские и устроена библиотека для заключенных с читальным залом.

Не ранее 1936 года утрачена восточная стена с башнями по 2-й Сергиевской улице (ныне ул. Володарского).

В 1950-е годы купол над святыми воротами разобран, здание храма было отреставрировано как исторический памятник республиканского значения.

В 1930 и 1984 годах на территории монастыря размещался архив Октябрьской революции, позже переименованный в ГАКО, с 1984 года, Научно-методический центр Управления культуры и библиотека для слепых.

В течение 70 лет древняя обитель пребывала в запустении. В 1993 году часть храмового комплекса была возвращена Церкви и передана Курско-Белгородской епархии, а в 1994 году монастырю были отданы настоятельский и сестринский корпуса. В здании храма разместились классы и церковь Курской Духовной семинарии. С участием семинаристов был проведен ремонт и устроен иконостас. 26 августа 1993 года состоялся архиерейский чин освящения храма, и в нем возобновились богослужения.