Идея создания городского историко-краеведческого музея возникла благодаря Совету ветеранов войны, труда и Вооруженных сил совместно с Администрацией города Кумертау. 1 июня 1998 года, в Международный день защиты детей, музей начал свою работу. Он объединил музеи промышленных предприятий, таких как Кумертауское авиационно-промышленное предприятие, производственное объединение «Башкируголь», АООТ «Искра» и ТЭЦ. На момент открытия в музее были оформлены два зала: «Природа» и «Этнография». Первым директором учреждения стала Светлана Федоровна Крысанова.

Историко-краеведческий музей является некоммерческой организацией, которая не ставит целью получение прибыли. Он зарегистрирован как юридическое лицо и принадлежит городскому округу Кумертау в Республике Башкортостан.

Основная цель музея, служение обществу и содействие его развитию через сбор, хранение, исследование, популяризацию и показ материальных свидетельств о человеке и его окружении для образовательных и исследовательских целей. Музей также стремится удовлетворять духовные потребности жителей Республики Башкортостан и предоставлять информацию посетителям, а также учреждениям и организациям как в России, так и за рубежом.

Кумертауский историко-краеведческий музей занимается сбором, хранением, реставрацией и демонстрацией предметов, связанных с жизнью человека и его окружением. Он создает экспозиции и выставки, проводит экскурсии, культурные мероприятия, лекции, творческие встречи и юбилейные события.