Монастырскую колокольню планировали построить над восточными воротами ограды, напротив кладбища, но из-за слабости грунта это оказалось невозможным. В итоге в 1894 году колокольню возвели над воротами в северо-западной части ограды, по проекту, напоминающему колокольню костромского Богоявленско-Анастасиина монастыря. В 1930-е годы, во время разорения монастыря, она была разрушена, однако сохранились её основание с воротами и несколько фотографий начала XX века, которые позволяют её восстановить.

Даже по фотографиям видно, как к концу XIX века русское церковное зодчество пришло в упадок. Нижний ярус колокольни с величественной аркой ворот и парными апсидами со стороны монастырского двора, хотя и несёт в себе элементы эклектики, всё же оригинален и художественен. В то же время восьмигранная шатровая часть колокольни выглядит неуклюжим и неудачным повторением костромского образца.

Тем не менее, стоит отметить, что даже в это непростое для зодчества время сохранялась некоторая преемственность: высота колокольни составляла 43 метра, как и у колокольни церкви Василия Великого в Рыбной слободе, а также у Богоявленской шатровой колокольни на Торговой площади, обе из XVIII века.

Проект восстановления колокольни Староторжского монастыря уже подготовлен, и ведётся работа над проектом поэтапного восстановления всего монастырского комплекса.