Согласно писцовым книгам 1628 года, село Никольское на Киржаче было пожаловано князю Алексею Юрьевичу Сицкому за участие в обороне Москвы во время похода королевича. Князь Сицкий, занимавший должность начальника Приказа Казанского дворца, был женат на княжне Евдокии Дмитриевне Пожарской. В писцовых книгах XVII века упоминается храм в селе Аргуново: деревянная шатровая церковь Николая Чудотворца, в которой находились иконостас, царские врата, иконы, книги и свечи. При церкви служил священник Василий. В приходе было два священника, каждый из которых обслуживал по 96 дворов, а к 1707-1708 годам, по 107.

По местным преданиям, до строительства каменного храма здесь стояли две деревянные церкви, от которых сохранились царские врата и железный восьмиконечный крест. Эти церкви находились на месте нынешнего кладбища, к северу от руин каменного храма. В 1795 году на месте деревянных церквей был построен каменный храм, к которому в 1826 году пристроили теплую трапезную. Каменная колокольня была возведена в 1813 году. В храме было пять престолов: в холодной части, в честь святителя Николая Чудотворца, апостолов Петра и Павла и великомученицы Варвары, в трапезной, Крещения Господня и пророка Илии. Над главным престолом устроена сень на четырёх столпах. В 1833 году церковь и кладбище обнесли каменной оградой с пятью башнями и пятью воротами, была построена каменная сторожка.

В начале 1950-х годов в храме ещё проводились службы. Однако 18 марта 1957 года исполком облсовета принял решение о сносе аварийного здания церкви в посёлке Аргуново, подписанное председателем В. Споровым. В справке от 15 марта 1957 года, подписанной И. Мирским, говорилось, что здание, построенное в 1795 году, не представляет архитектурной или исторической ценности и находится в аварийном состоянии. Фундамент и кирпичная кладка стен разрушались, особенно в углах основного здания и колокольни. Решётки и рамы в оконных и дверных проёмах отсутствовали. Было решено удовлетворить просьбу Покровского райисполкома о сносе аварийного здания.

Церковь была взорвана в 1960-х годах, оставив после себя груду битого кирпича и погнутые оконные решётки, которые, согласно документам, отсутствовали. Колокольня, считавшаяся аварийной, пережила взрыв и до сих пор возвышается над лесами и полями. От села осталось только кладбище.