В конце XVII, начале XVIII века в возрожденном городе на берегу реки Учи была возведена пятиглавая каменная церковь во имя Живоначальной Троицы. Это была первая из трех церквей современного Троицкого прихода. В 1739 году к ней пристроили вторую церковь, посвященную Казанской иконе Божией Матери, и возвели колокольню.

Позже был построен двухъярусный храм в честь Тихвинской иконы Божией Матери с придельным алтарем во имя пророка Илии и утепленным приделом в честь Преподобных Зосимы и Савватия Соловецких Чудотворцев. В теплом приделе находилась библиотечная комната, вмещавшая более 1000 томов книг религиозно-нравственного содержания.

На месте бывшей крепости возвели каменную колокольню и две соборные церкви: одну каменную, посвященную Зачатию Святой Анны, и другую деревянную, в честь Николая Чудотворца. Хотя точные даты их постройки неизвестны, они отмечены на дорегулярном плане города Любима 1767 года.

Позднее, вероятно из-за ветхости, эти храмы были разобраны или перестроены. В 1798 году на их месте был возведен каменный Богоявленский собор, а в 1825 году рядом с ним построили каменный одноглавый Крестовоздвиженский собор. Оба собора сохранились до наших дней.