Храм был возведён примерно в 2004-2005 годах и освящён в честь Святой Живоначальной Троицы, так как икона с этим образом установлена над входом в храм и на кладбище.

Балдыж впервые упоминается в начале XVII века как существующее село, принадлежавшее Безобразовым. В XVIII веке оно временно носило другое название, Богородицкое. В XIX веке селом владели В. Д. Азанчевский и И. И. Коровкевич.

К началу XVII века в селе уже стоял приходской храм Флора и Лавра, который сгорел в годы Смуты. В 1690-х годах был построен каменный храм, который упразднили в начале XX века из-за ветхости.

В XVII и XVIII веках село входило в состав Подгородного стана Брянского уезда. С 1861 по 1924 год оно находилось в Госамской волости Брянского (с 1921 года, Бежицкого) уезда. В 1924 и 1929 годах село относилось к Овстугской волости, а с 1929 года, к Брянскому району. С 1920-х годов оно входило в состав Глинищевского сельсовета.