В январе 2003 года в Володарском районе была зарегистрирована православная община прихода храма, посвященного Святому Богоявлению. В 2005 году под строительство храма выделили участок земли. Осенью 2007 года начались богослужения, которые сначала проводились во временной палатке, а затем в временном храме, созданном из двух списанных железнодорожных вагонов. С 2008 года богослужения стали регулярными. В 2010 году храм был переосвящён в честь Блаженной Ксении Петербургской, и прежнее название Богоявленский больше не используется.

В ноябре 2012 года, в связи с планами по строительству торгового центра и нового каменного храма, существующий храм перенесли на 140 метров к северо-востоку. Одновременно участок под строительство нового храма был обнесен оградой.