Во второй половине 19 века жители Паникин решили построить новый кирпичный храм с колокольней. Для руководства строительством пригласили мастеров из других мест, а все село активно помогало. Холм под церковь насыпали вручную, а в соседнем Сирокином Яру построили кирпичный завод. Молоко и яйца для раствора собирали по селу. Все работы выполнялись вручную, и строительство длилось долго. После завершения храм расписывали, и только в 90-х годах 19 века он был освящен.

Согласно «Справочной книге о церквах, приходах и причтах Курской епархии за 1908 год», в селе Паники находится Богородичная церковь, построенная из камня в 1877 году. У нее два престола, а приход насчитывает 1481 православного и 3 раскольника. При храме работала церковно-приходская школа. Служили священник Владимир Матвеевич Попов, дьякон Николай Петрович Солнцев и псаломщик Григорий Романович Пузанов. Храму принадлежали 1,8 десятины усадебной и 34 десятины полевой земли.

После принятия в 1918 году декрета «Об отделении церкви от государства и школы от церкви» началось массовое закрытие храмов, конфискация церковного имущества и аресты священников. В итоге церковь в селе Паники была закрыта.

В настоящее время храм реставрируется, и службы в нем возобновлены.