Храм Рождества Иоанна Предтечи в селе Махновка Суджанского района был возведен около 1870 года. По словам местных жителей, его строительство велось на средства, собранные жителями, а также на добровольные пожертвования состоятельных людей, искренне верующих в Иисуса Христа. Во время Великой Отечественной войны храм был закрыт, но после войны богослужения возобновились. В 1954 году храм окончательно закрыли, и он стал использоваться колхозом как зернохранилище. Полы были полностью сорваны, а колокольня разрушена.

Восстановление храма началось в 1990 году. В настоящее время ведутся работы по восстановлению купола колокольни, и процесс восстановления храма близится к завершению.