Между двумя Трехгорными и одним Нововаганьковским переулками расположена церковь с непростой судьбой. Известная с 1620-1630-х годов, она не раз меняла название и неоднократно перестраивалась. Изначально деревянная, возведенная прихожанами из Государева Псарного двора, она была перестроена в камне в 1762 и 1775 годах. С тех пор церковь расширялась, добавлялись приделы, а в 1860 году появилась колокольня и трапезная, увеличив площадь здания в два с половиной раза.

Прихожанами и попечителями храма были состоятельные люди, среди которых фабриканты Прохоровы, владельцы соседней Трехгорной мануфактуры. Из-за хаотичности предыдущих построек и роста числа прихожан потребовалась новая перестройка. Она была проведена в 1900-1902 годах по проекту архитектора Георгия Александровича Кайзера на средства крупных торговцев Копейкиных-Серебряковых, живших в приходе. После реконструкции церковь была освящена заново в 1902 году, но работы завершились только в 1908 году.

В начале XX века большинство прихожан составляли рабочие Трехгорной мануфактуры. В бурные 1905 и 1917 годы они охраняли собор, находившийся в центре революционных событий на Пресне, благодаря чему храм не пострадал и не был разграблен.

В 1920-х годах одним из регентов храма был Александр Васильевич Александров, автор гимна СССР.

Церковь закрыли в 1928 году. Ее обезглавили, в стенах сделали проемы, а верх колокольни разобрали. В обезображенном здании разместился дом пионеров/дом культуры имени Павлика Морозова. Переулок, ранее называвшийся Никольским благодаря церкви, также переименовали в честь пионера.

Храм был возвращен верующим в 1992 году. Восстановительные работы проводились в 1991 и 2000 годах по проекту Г.А. Кайзера. При храме действуют воскресная школа, библейский колледж, клуб исторической реконструкции средневековых культур и центр современного искусства «АртЭриа».