Храм святителя Николая в селе Купино был возведен в 2001 году на месте, где в 1960-е годы была разрушена деревянная Георгиевская церковь XVIII века.

История храма Святителя Николая Чудотворца в селе Купино тесно связана с церковью великомученика Георгия Победоносца в селе Репное. В XVIII веке здесь была построена деревянная Георгиевская церковь, которая существовала до 1960-х годов, после чего на её месте возвели клуб.

Процесс возрождения храма начался в 1994 году, когда здание клуба было передано Церкви. В восстановленном Георгиевском храме богослужения проводились до 2001 года.

В 2000 году архиепископ Белгородский и Старооскольский Иоанн освятил место для строительства нового храма в селе Купино. Храм в честь Святителя Николая был построен в двух километрах от прежнего места и освящен архиепископом Иоанном 16 декабря 2001 года. При храме работает детская воскресная школа.