Старообрядческий Клинцовский Николо-Пустынский монастырь был основан в 1744 году и к началу XIX века достиг своего расцвета. Историк И. Логинов описывал, что со стороны посада Клинцы в монастырь вели столбовые деревянные ворота с главой наверху. От ворот налево, вдоль восточной ограды, располагались пять домов. Вдоль южного забора стояли еще девять домов такого же размера. От ворот, с юга на север, тянулись четыре огромных одноэтажных корпуса. Между ними находились два примечательных флигеля. По северной стороне располагались восемнадцать келий с садиками спереди. В центре возвышались два храма: один, большой соборный храм во имя Преображения Господня длиной около 20 саженей, с десятью главами и одноярусной колокольней высотой 15 саженей; другой храм, вдвое меньше, был посвящен Святителю Христову Николаю.

В монастырских церквях хранилось несколько сотен икон, привезенных из старых церквей и монастырей, а также множество кованных светильников, литых складней и богослужебных книг. Иконы украшались серебряными ризами с парчовыми и бархатными пеленами, расшитыми бисером. С потолка свисали паникадила с золочеными прорезными яблоками и серебряными перьями. Особую ценность представляли ковчеги, запрестольные и благословляющие кресты, выполненные из серебра и золота, а также резные иконостасы, украшенные червонным золотом. Однако с воцарением Николая I, противника старообрядчества, все изменилось. В 1835 году сгорела деревянная Никольская церковь. В 1837 году, чтобы оказать давление на монахов, не желавших принимать единоверие, из оставшейся церкви удалили священников. К 1850 году в монастыре оставалось лишь 6 монахов и 12 послушников. В 1880 году сгорел Преображенский храм.

Возрождение монастыря началось в 1905 году, когда был опубликован манифест «Об укреплении начал веротерпимости». Был объявлен сбор средств на строительство нового храма во имя Нерукотворного Спаса по проекту архитектора Шебуневского. Строительство началось весной 1909 года, и к концу 1910 года храм был завершен, увенчанный блестящими куполами. Стены храма были расписаны византийскими религиозными сюжетами. Церковь впечатляла множеством икон, две из которых были в человеческий рост и в драгоценных окладах. Колокольня достигала высоты 60 аршин. Во время Первой мировой войны несколько келий монастыря были переоборудованы под госпиталь, который полностью содержался монастырем. В 1919 году монастырь был разгромлен хулиганами-атеистами, а в 1923 году обитель закрыли. До 1937 года церковь использовалась как приходская, а затем и она была закрыта. В здании сделали перегородки, создав комнаты, которые заселили людьми. В таком состоянии люди жили до 2015 года, пока их не выселили из ветхого здания.