Первая церковь в Новодеревянковской курене, основанном в 1821 году, была возведена в 1830 году благодаря усилиям прихожан и щедрым пожертвованиям. Это была небольшая деревянная церковь с одной главой и железной крышей, стоявшая на кирпичном фундаменте. В её архитектуре прослеживалось влияние Успенской церкви из соседнего Стародеревянковского куреня и некоторых элементов деревянной церкви святой Екатерины из Екатеринодара. На строительство храма, колокольни и ограды было потрачено 4050 рублей серебром.

К Рождество-Богородицкой церкви относилась часовня святого Иоанна Предтечи, построенная и освящённая в 1881 году. Она находилась в 18 верстах от станицы, в хуторе генерала И.Д. Попко.

В 1888 году (по другим данным в 1887) в приходе Рождество-Богородицкой церкви станицы Новодеревянковской была открыта одноклассная школа. В её программе основное внимание уделялось Закону Божьему, который изучался шесть раз в неделю и включал молитвы, священную историю, порядок богослужения и основы вероучения. Также проводились занятия по церковному пению, чтению церковной и гражданской литературы, русскому языку, письму и арифметике. Для школы казак Иосиф Пальчун построил дом.

В 1895 году при церковно-приходской школе открылся подготовительный класс, который 6 февраля 1899 года был присоединён к школе как её первое отделение. В 1899/1900 учебном году в трёх отделениях школы обучалось 70 детей, включая 10 девочек.

7 января 1935 года комсомольцы сожгли единственную на тот момент действующую в округе Рождество-Богородицкую церковь.