Теплый храм, посвященный Рождеству Пресвятой Богородицы, долгое время после восстановления монастыря оставался главным местом для соборной молитвы монахов и паломников. Первоначально эта церковь, построенная в 1819 году и находящаяся в одном здании с трапезной, была освящена во имя Всех Святых.

Согласно старинной описи, внешний и внутренний облик церкви был следующим: «Церковь теплая, каменная, во имя Всех Святых, расположена в здании, которое внутри монастыря двухэтажное, а снаружи трехэтажное; под церковью находятся братская трапеза и кухня; здание полностью покрыто железом. Над крышей небольшой глухой трибун, также обитый железом, с главкой и крестом. Длина церкви составляет 39 аршин, ширина, 19 1/4 аршина. Потолок поддерживается двумя рядами круглых деревянных колонн (сейчас их нет, прим. ред.)… Местные иконы выполнены живописно. Клиросы закрыты высокими старыми киотами; в правом киоте находится Казанская икона Божией Матери, высотой 7 и шириной 6 1/4 вершка, в серебряно-золоченой оправе с венцами… корона украшена жемчугом, по углам 4 желтых камня, обрамленных стразами, а на ризе среди жемчуга простые разноцветные камушки. За левым клиросом вторая копия чудотворной Иконы «Знамения» Божией Матери, риза серебряная с позолотой, местами украшена жемчугом, венец и корона инкрустированы различными камнями. Справа в ряд с основным помещением небольшой придел во имя Святой Троицы, освященный 23 ноября 1832 года преосвященным Илиодором».

Храм Рождества Пресвятой Богородицы был восстановлен в 1991 году и освящён Святейшим Патриархом Алексием II 19 сентября того же года.