Старая церковь Покрова Пресвятой Богородицы в селе Подольхи, которая не сохранилась до наших дней, была построена за 15 лет и освящена в 1895 году. Она находилась на территории старого кладбища. Церковь была трёхпрестольной, с одним большим куполом, кирпичной, окружённой кирпичной стеной и украшенной железной оградой. Колокольня была частью храма. С приходом советской власти церковь закрыли, и здание использовалось как зернохранилище.

Во время Великой Отечественной войны здание заняли немцы. Летом 1943 года здесь располагался эвакуационный госпиталь №2329. В 1951 году часть здания разобрали для нужд колхоза, а в 1955 году церковь была взорвана.

Новый храм разместили в бывшем здании школы, которое перепроектировали для богослужений. Реконструкцией занималась Колесникова Л.И., главный архитектор Белгородской епархии. В декабре 2006 года храм освятил Архиепископ Белгородский и Старооскольский Иоанн.