Первые упоминания о деревянной церкви Знамения Богородицы датируются 1774 и 1784 годами. 18 июня 1885 года губернский архитектор Баумиллер представил проект строительства каменного храма в селе Борки, который был утверждён уже 19 июня того же года. В 1886 году началось строительство нового храма, который освятили в 1898 году. Росписи в церкви были выполнены не ранее 1903 года, что подтверждается изображением преподобного Серафима Саровского, канонизированного в том же году. Главный престол посвящён Курской Коренной иконе Божией Матери, в правом приделе, святому Тихону Задонскому, а в левом, Владимирской иконе Божией Матери. До Октябрьской революции к приходу церкви относились село Борки и деревня Спальная, находящаяся в двух вёрстах от него, с числом прихожан в 1890 году, 2128 человек. В 1903 году приход включал 213 крестьянских и 3 некрестьянских двора в селе Борки и 104 крестьянских и 1 некрестьянский двор в деревне Спальная. В 1890 году при церкви работала начальная школа, а в 1898 году была открыта одноклассная земская школа и школа грамоты.

После принятия декрета СНК РСФСР от 23 января 1918 года храм продолжал действовать по договору с Уланковским волостным советом, заключённым 10 ноября 1920 года. Согласно декрету ВЦИК от 23 февраля 1922 года, из храма изъяли пять предметов церковного имущества, в том числе серебряный крест и ризы. В 1937 году из-за отсутствия священника богослужения прекратились, а в феврале 1940 года религиозная община распалась, и здание передали колхозу для использования как зернохранилище. В 1940 году церковь была закрыта, так как не функционировала с 1937 года. Богослужения возобновились в 1942 году, а 20 сентября 1944 года было зарегистрировано религиозное общество, включающее несколько сёл.

В мае 1955 года богослужения снова приостановили из-за отсутствия священника. В 1960-х годах храм был отреставрирован художниками из Харькова и Курска. 17 декабря 1993 года был принят Устав Свято-Знаменского прихода, зарегистрированный 25 декабря того же года. 26 сентября 1997 года возобновили регистрацию религиозной организации Свято-Знаменский приход Русской православной церкви. В 1998 году храм был признан памятником культовой архитектуры регионального значения.

1 апреля 2012 года храм посетил архиепископ Курский и Рыльский Герман. Пятиглавый каменный храм, построенный в византийском стиле, расположен на возвышенности и виден из близлежащих сёл. Росписи храма отличаются тем, что изображения святых расположены по "типам святости" с редкими сюжетными композициями. На куполе изображено небо со звёздами, а в парусах, апостолы-евангелисты.

Главный иконостас храма четырёхъярусный, правый и левый, трёхъярусные, все позолоченные и резные. В иконостасе размещены пятнадцать праздничных икон, которые не следуют литургическому календарю, а раскрывают икономию Спасения. Праздничный ряд делится на группы икон, составляя несколько программ. В центре иконостаса вокруг иконы Тайной вечери находятся иконы Сретения Господня, Богоявления, Входа Господня в Иерусалим и Преображения Господня. Справа налево расположены образы, связанные с Христианскими праздниками, такими как Обрезание Господне и Сошествие Святого Духа. Богородичный цикл представлен иконами Рождества и Успения Пресвятой Богородицы. Праздничный ряд иконостаса протягивается через все три придела церкви. Над Царскими вратами в северном приделе находится икона Воскресения Иисуса Христа, а по обе стороны от неё, иконы Усечённой главы святого Иоанна Крестителя и Введения во храм Пресвятой Богородицы. В южном приделе над Царскими вратами расположена икона Рождества Христова, а рядом, Воздвижение Креста Господня и Покров Пресвятой Богородицы.