В 1880-х годах, благодаря инициативе профессора Н.В. Склифосовского, на Девичьем поле началось возведение Клинического городка Московского университета. Одним из ключевых зданий этого комплекса стала Факультетская клиника, строительство которой финансировалось государством. Закладка здания состоялась 22 сентября 1887 года, а открытие прошло в 1890 году.

Ранее клиника находилась на Рождественке и включала терапевтическое и хирургическое отделения. Проект зданий разработал архитектор К.М. Быковский. Корпуса клиники, расположенные на Большой Пироговской улице, образуют единый ансамбль с Госпитальной клиникой, которая находится неподалеку. Фасады обеих клиник почти идентичны и симметричны, однако планировка Факультетской клиники проще. Здесь обучались студенты младших курсов, в отличие от Госпитальной клиники.

Архитектура зданий напоминает московские усадьбы XVIII века. Главный вход, оформленный в виде портика с колоннами, находится в одноэтажной части здания, удаленной от красной линии. В 1897 году в курдонере перед входом был установлен памятник Н.И. Пирогову, выполненный В.О. Шервудом.

Основные части клиники состоят из двух- и трехэтажных боковых корпусов, расположенных параллельно Большой Пироговской улице и отделенных от нее палисадниками. Фасады, как и большинство зданий комплекса, выполнены в стиле итальянского Ренессанса с использованием горизонтального руста и карнизов. Оконные обрамления различаются на каждом этаже.

В разработке чертежей активно участвовали выпускники Училища живописи, ваяния и зодчества С.И. Соловьев и И.М. Машков. Внутренние помещения были тщательно продуманы, что позволяет использовать здание по назначению и сегодня. Важной частью стала система изоляции разных категорий посетителей: пациентов, студентов, инфекционных больных и обслуживающего персонала.

В настоящее время в здании располагаются Клиника урологии им. Р.М. Фронштейна и Кафедра иностранных языков.