Музей в Радужном впервые открыл свои двери 28 марта 1989 года при Доме пионеров. Его создание инициировал Геннадий Рудольфович Волков.

Музей, носивший название «Нефтяной край, судьба моя», демонстрировал небольшую экспозицию, включавшую национальную одежду хантов и ненцев, предметы быта, а также инструменты для охоты и рыбалки. Здесь можно было увидеть материалы о деятельности промысловой артели посёлка Варьёган в 40-50-х годах и фотографии Н. Старовартовского, иллюстрирующие жизнь хантов и ненцев. В 1991 году музей был передан Детскому центру Профориентации при ДК «Нефтяник» и разместился в перестроенной четырехкомнатной квартире на первом этаже дома № 8 седьмого микрорайона. Фонды музея пополнялись благодаря пожертвованиям жителей города и поездкам в посёлок Варьёган. Эколого-этнографический музей был официально зарегистрирован 24 октября 2000 года постановлением администрации города Радужный.

С 1 ноября 2000 года музей начал функционировать как самостоятельное учреждение. В разделе «Геология нефти и газа, палеонтология» представлена информация об условиях образования нефтяных и газовых месторождений в Западной Сибири. Также здесь можно увидеть кости мамонта, найденные в Радужном в 2003 году. Экспозиция продолжает рассказ об освоении нефти и газа в Ханты-Мансийском автономном округе.