В монастыре находились три церкви: каменная холодная, посвященная Иверской иконе Божией Матери, каменная теплая с тремя приделами, главный из которых был в честь Знамения Божией Матери, преподобного Петра Афонского и великомученицы Варвары, а также деревянная домовая церковь в честь Казанской иконы Божией Матери. Изначально домовая церковь находилась в главном деревянном корпусе монастыря. В 1908 году был построен новый каменный сестринский корпус с домовой церковью, выделенной куполом.

После событий 1917 года и в советское время на территории монастыря размещались различные организации: приют для бездомных детей, в годы войны госпиталь, в тридцатые годы дом-интернат для престарелых и инвалидов. С 1990 года здесь находился психоневрологический дом-интернат. Знаменский храм был разрушен, его взорвали, а, по словам очевидцев, кирпич использовали для мощения дороги в Котовск. С Иверского храма сняли купола, а кирпич пошел на строительство Котовского дворца культуры. Сам храм стал складом. Казанская домовая церковь была переоборудована под клуб. Монастырская стена разрушалась, а коммуникации ветшали.

В 2002 году, после назначения на Тамбовскую кафедру, епископ Феодосий благословил возрождение Сухотинского Богородице-Знаменского женского монастыря. По его инициативе распоряжением губернатора области О. И. Бетина был создан координационный совет по возрождению монастыря. В сентябре 2004 года члены совета посетили монастырь и приняли программу его комплексного восстановления. Велаcь работа по передаче епархии сохранившихся монастырских келейных корпусов и трапезного корпуса с домовой церковью в честь Казанской иконы Божией Матери.