12 марта 1964 года в Доме Советов, который был снесен в 1988 году, открылся Народный краеведческий музей города Мелекесса. Организатором и первым директором на общественных началах стал землеустроитель Николай Иванович Марков. Основу музея составила коллекция, собранная в 20-е и 50-е годы XX века краеведом Степаном Георгиевичем Дырченковым.

С 1978 года музей размещается в одном из самых красивых зданий города, построенном в начале прошлого века на средства купца Ф. Г. Маркова. 19 декабря 1974 года Марков был удостоен звания Почетного гражданина города Димитровграда за значительный вклад в создание музея и летописи города.

1 января 1977 года музей получил статус государственного и стал филиалом Ульяновского областного краеведческого музея им. И. А. Гончарова. В 1996 году он стал муниципальным учреждением культуры, а в 1999 году вошел в ассоциацию муниципальных музеев Среднего Поволжья «Содружество».