В 1863 году в селе Шапта была построена небольшая деревянная часовня, крытая тесом, в честь Покрова Пресвятой Богородицы. По преданию, часовня появилась после того, как жителю деревни Ивану Кугуза явилась икона Покрова Пресвятой Богородицы. Это событие побудило его и его семью отказаться от языческих верований и стать христианами. По совету духовного наставника Иван построил часовню на месте явления иконы и поместил в ней обретенную святыню. В часовне также хранилась икона Святителя Николая Чудотворца.

1 ноября 1873 года был открыт Шаптинский приход. Строительство однопрестольной церкви на каменном фундаменте началось 1 апреля 1874 года и завершилось к осени того же года. Церковь, небольшая по размеру, была освящена 11 ноября 1874 года в честь Владимирской иконы Божией Матери.

Со временем деревянная церковь обветшала, а население прихода увеличилось до 1900 человек. В 1882 году священник Алексей Галицкий обратился к епископу Вятскому и Слободскому Алексию с просьбой разрешить сбор средств на строительство каменного храма, и получил благословение.

Проект трехпрестольного каменного храма был выполнен к маю 1902 года известным Вятским губернским архитектором Иваном Аполлоновичем Чарушиным. Яков Щенников, мастер каменных дел из Яранского уезда, взял подряд на строительство и к осени 1911 года выполнил его «добросовестно и достаточно прочно», не отклоняясь от проекта.

Строительство храма в небольшом приходе заняло много времени. Пожертвования на его возведение собирали по всей епархии. Архитектура храма напоминает формы русского зодчества XVII века. Внутренние помещения перекрыты кирпичными сводами разных типов. Четырехярусный иконостас с резными колоннами и богатым орнаментом сочетает древнерусские традиции с барокко. Настенная роспись выполнена художником Иваном Филипповичем Селезневым, что подтверждает надпись на стене храма: «Живописная работа производилась в 1928 году, окончена в 1929 году. При настоятеле о. Василии Бессонове, церковном старосте Василии Александровиче Дубровине, при председательстве церковного совета Андрее Ефимовиче Одинцове мастером живописцем Иваном Филипповичем Селезневым». Роспись выполнена в стиле торжества Новозаветной Церкви.

Освящение нового каменного храма и его главного престола, посвященного Божией Матери в честь Владимирской иконы, приурочили к 100-летию победы русской армии над Наполеоном, 8 января 1913 года.