Троицкий собор в Варнавине включает три храма: Троицкий, каменный, с колокольней, возведен в 1836 году на средства церкви и прихожан; Николаевский, деревянный, однопрестольный, посвящен святителю Николаю Чудотворцу, построен в 1666 году на средства бывшего монастыря, а в 1854 году обновлен казанскими купцами Тихоновыми; Успенский, также деревянный, возведен в 1847 году на средства собора и прихожан. Ограда вокруг собора каменная. Кладбище расположено за пределами города, на нем находится Крестовоздвиженская церковь с отдельным причтом.

В Троицком храме три престола: в честь Живоначальной Троицы, Корсунской иконы Божией Матери и преподобного Варнавы Ветлужского. Успенский храм также имеет три престола: в честь Успения Божией Матери, святого Архистратига Михаила и прочих Сил бесплотных, а также святителя Митрофана Воронежского. В Николаевском храме под спудом покоятся мощи преподобного Варнавы, и здесь много икон древнего письма.

От Костромы до Варнавина 384 версты. Ближайшие церкви: Крестовоздвиженская на кладбище, Николаевская в селе Лапшанги в 5 верстах, Богородицкая в селе Беберина в 6 верстах и Богословская в селе Богословского в 22 верстах.

Все три храма были утрачены в 1930-е годы, а мощи преподобного перенесены в кладбищенскую церковь. Их дальнейшая судьба неизвестна. В 2000 году рядом с местом, где находился Троицкий собор, была построена деревянная церковь в честь преподобного Варнавы Ветлужского.