Согласно писцовым книгам 1628 и 1630 годов, село Синжаны принадлежало князю Ивану Борисовичу Черкасскому как приданая вотчина, доставшаяся от боярина Василия Петровича Морозова. В селе находилась церковь Усекновения главы Иоанна Предтечи, построенная мирянами, при которой служили священник и дьячок.

Этому же владельцу принадлежали деревни Данилова и Софронова, которые до сих пор входят в состав Синжанского прихода.

В окладных книгах 1676 года о Синжанском приходе указано: "в селе Синжанах церковь Иоанна Предтечи; при ней двор попа Максима и дьячков, в приходе: двор боярский, где живет прикащик, 27 крестьянских и 6 бобыльских дворов".

Упомянутая церковь Иоанна Предтечи существовала в Синжанах до 1780 года, когда она обветшала настолько, что служить в ней стало опасно. С благословения епископа Владимирского Иеронима была построена новая деревянная церковь.

Немного ранее, в 1772 году, в Синжанах возвели теплую деревянную церковь во имя Святого Николая Чудотворца.

В 1863 году началось строительство каменного храма, трапеза которого была завершена и освящена в 1868 году, а главный храм, в 1881 году. После этого деревянные церкви разобрали.

В новом храме три престола: главный во имя Живоначальной Троицы, в трапезе, в честь Казанской иконы Божией Матери и Святого Иоанна Предтечи.

Церковь хорошо снабжена утварью, ризницей, святыми иконами и богослужебными книгами. Из прежних времен сохранилось напрестольное Евангелие с надписью: "в 7165 году, 29 августа, приложил от себя эту святую книгу и душеспасительную, вводящую в царство небесное всех православных христиан и в жизнь вечную, напрестольное Евангелие в Муромском уезде, село Синжаны, в церковь Усекновения Честной главы Святого пророка и Предтечи Крестителя Господня Иоанна, Животворящего Креста и собору Архистратига Михаила, уроженец, что был в мире диакон Иван Алексеев, а в иночестве Иосиф, а бархат на Евангелии, Евангелисты серебряные позолоченные и с застежками и с жуками, и Божьим изволением с помощью я, многогрешный чернец, радел и собирал и подаянием прихожан и мирских всяких людей и Московских строилось Святое Евангелие, а приложил при священнике Измаиле Иванове и ему пожаловал на просвиромисание и на литургию во святых своих молитвах незабвенно учинит, а по смерти душу мою поминать и родителей моих".

В церковном архиве сохранилась грамота, выданная епископом Иеронимом в 1780 году на строительство храма.