В писцовых книгах за 1676 год упоминается, что в селе была деревянная церковь, посвященная Живоначальной Троице. В ней находились иконы Живоначальной Троицы, Пресвятой Богородицы Одигитрии и святого великомученика Дмитрия Солунского. Церковь была построена по указу архимандрита Пахомия из Макарьевского монастыря, расположенного на желтых песках, и освящена в 1667 году.

В этом же селе была еще одна деревянная церковь, посвященная Покрову Пресвятой Богородицы, построенная в 1673 году на средства прихожан. Церковь была окружена забором с воротами. На церковной земле располагались дворы священников Якова и Афанасия Ивановых, дьякона Кирилла Афанасьева, просвирни, место для пономаря и два двора бобылей.

Эти две церкви существовали в Яковцеве до начала XIX века. В период с 1816 по 1820 годы вместо деревянных церквей был построен каменный храм, внешний вид которого оставался неизменным до 1896 года, хотя внутреннее убранство обновлялось несколько раз. В храме было три престола: главный, во имя Живоначальной Троицы, и два в теплых приделах, в честь святого Николая Чудотворца и Покрова Пресвятой Богородицы.

Церковь была хорошо снабжена утварью, ризницей, святыми иконами и богослужебными книгами. Особой святыней считались два небольших креста с частицами святых мощей. В первом кресте находились мощи главы Иоанна Предтечи, Василия Великого, Иакова Боровицкого, Сергея Радонежского, Иоанна Многострадального, епископа Новгородского Антония Римлянина, архидиакона Стефана и других. Во втором кресте хранились частицы мощей благоверного князя Константина Муромского и его сыновей Михаила и Федора. Также сохранилось старинное напрестольное Евангелие, датированное 1657 годом.

По штатному расписанию при церкви служили два священника, дьякон и два псаломщика, получавшие на свое содержание около 1800 рублей в год из различных источников. Дома членов причта находились на церковной земле. Земельные владения церкви включали усадебную землю площадью 1 десятина 1038 сажен, пахотную, 27 десятин 404 сажени, сенокосную, 11 десятин 1775 сажен. Имелись план и межевые книги. Приход состоял из села Яковцева и деревень: Сапун, Спасское, Пожоги, Бежаново, Ползиково, Горушки, Голявино, Елемейка, Новинки. Согласно клировым ведомостям, в приходе числилось 549 дворов, 1573 мужчины и 1577 женщины, включая 147 мужчин и 150 женщин-раскольников.

В селе Яковцеве функционировала земская народная школа, где в 1896 году обучалось 92 человека, а также мужская и женская церковно-приходские школы, в которых учились 40 и 27 человек соответственно. В школе грамоты в 1896 году обучалось 10 человек. По церковно-метрическим книгам в конце XIX и начале XX века учителями церковно-приходской школы были Иван Васильевич Крылов, Михаил Иванович Неаполитанский и сельский учитель Лев Алексеевич Касторский.