С середины XVIII века село Малый Сундырь было центром крупного церковного прихода. В 1754 году здесь построили первую теплую деревянную церковь во имя Живоначальной Троицы, а в 1764 году, вторую, холодную, в честь Введения во храм Пресвятой Богородицы. Средства на строительство выделили прихожане, а инициатором выступил архимандрит Самуил из Чебоксарского мужского монастыря.

Когда деревянные здания обветшали, в 1829 году на средства прихожан возвели теплую двухпрестольную каменную церковь во имя Святой Троицы с приделом в честь Введения во храм Пресвятой Богородицы. Церковь выглядела великолепно: мраморные колонны у входа, сверкающие купола, белоснежные стены, ограда из красного кирпича и железных кружев, высокая колокольня с множеством колоколов. Внутреннее убранство было не менее роскошным, а главный иконостас считался одним из лучших в Козьмодемьянском уезде.

Церковь в селе Малый Сундырь функционировала почти два века, с 1754 по 1940 год. В советские годы, как и многие другие храмы, она была закрыта. В девяностые годы храм не смог возродиться из-за строительства Чебоксарской ГЭС. Село Малый Сундырь, вместе с соседними деревнями, оказалось в зоне затопления, и его жители были переселены, а здания снесены.

Церковь осталась, но иконы исчезли, а колокола были увезены. По распоряжению Совета Министров от 27 августа 1965 года храм предписали разрушить, а материалы использовать для строительства объектов колхоза «Сила». До начала реставрации сохранились лишь покосившаяся колокольня и небольшая часть основного здания, стоящие рядом с кладбищем в опустевшем селе.

В 2003 году началась реставрация храма. Работы взял на себя приход храма «Сошествия Святого Духа на апостолов» из соседнего села Усола под руководством настоятеля иерея Александра Малинова. Постепенно обновили кладку, восстановили алтарь, подняли купол и установили крест. Заново сделали кровлю и вставили окна. Сейчас продолжается реставрация колокольни.

По благословению Владыки в восстанавливающемся храме начались богослужения. Сегодня Свято-Троицкий каменный храм стоит одиноко, так как села Малый Сундырь и соседних деревень больше нет. Тем не менее, храм жив, и под его обновленными сводами вновь звучат молитвы.