Начало деревни Саломатной, расположенной на берегу одноименного озера, связано с основанием зимовья с таким же названием. Оно, вероятно, было создано по указу властей и находилось на пути к Ново-Ишимской оборонительной линии. По одним данным, зимовье основано в 1758 году, по другим, в 1765 году. Основателем деревни стал крестьянин Григорий Афанасьевич Казанцев, но откуда он переселился с семьей, неизвестно.

Изначально деревня Саломатная входила в состав Курганской слободы, а после образования Курганского уезда в 1782 году стала частью Сычевской волости. В 1840-х годах к местным жителям присоединились переселенцы из центральных губерний России, образовавшие отдельный поселок, что значительно увеличило население деревни.

С открытием Саломатовской волости в 1869 году возникла необходимость в священнике. Метрические книги при Саломатовской церкви начали вестись с 1878 года, и в том же году к приходу присоединили часть жителей из Лопатинского хутора. К 1924 году приход включал село Саломатовское и деревни: Банникову, Белянину, Копай, а также часть жителей деревень 1-я Дундина и Булдак. Этот состав прихода, вероятно, сохранялся до его закрытия Челябинским облисполкомом в 1936 году.

Для строительства первой церкви в селе Саломатовском прихожане в 1872 году приобрели в селе Чашинском старую деревянную церковь с оградой и воротами. На новом месте здание планировалось восстановить по старым чертежам, добавив крыльцо с колоннами и перилами. Епархиальное начальство разрешило строительство в октябре 1872 года, а изменения в плане, в 1873 году. Контракт на работы был заключен с крестьянином Яковом Антоновичем Соколовым. В 1874 году здание церкви было перевезено в Саломатовское, а 23 мая того же года выдана храмозданная грамота.

Церковь во имя Святой Троицы была заложена 2 июня 1874 года. Во время закладки крестьяне бросили под фундамент монеты, но вскоре они были похищены, и закладку пришлось повторить. Строительство велось на средства прихожан и завершилось в феврале 1876 года. К июлю 1877 года здание было полностью готово и окрашено. Антиминс для нового храма освятил епископ Ефрем 7 августа 1877 года, а церковь была освящена 20 ноября 1877 года.

Первоначально в церкви был установлен старый иконостас из села Чашинского. Однако к 1880-м годам он обветшал, и в 1882 году прихожане решили его обновить. В 1885 году был заключен договор с подрядчиком Василием Степановичем Виноградовым на устройство нового иконостаса. Работы завершились в ноябре 1886 года, а 2 марта 1887 года церковь была вновь освящена.

К началу XX века старая деревянная церковь уже не могла вместить всех прихожан и была в плохом состоянии. С 1902 года начался сбор средств на строительство нового каменного храма, который был завершен вчерне в 1915 году. В 1919 году он еще не был окончательно отделан, но в 1923 году, вероятно, был освящен.

Церковь прекратила свою деятельность в 1930 году, в 1934 году был запрещен звон колоколов, а в 1936 году она была закрыта. К 1947 году здание было частично разрушено и использовалось как зерносклад. Однако оно сохранилось до наших дней и является объектом культурного наследия Курганской области.