Деревянная церковь-школа была возведена в Трубайке, одной из отдалённых деревень владычнинского прихода, в 1900 году. Вероятно, существующий ныне деревянный храм с одной главой и шатровой колокольней был построен после 1908 года как приходской. Его закрыли не позднее 1930-х годов, после чего здание использовалось как хлев, а затем было заброшено. Сейчас оно находится в аварийном состоянии и постепенно разрушается. Деревня опустела примерно в начале 1990-х годов.