В 1743 году Нефёд Никитич Кудрявцев построил первую церковь в Акшуате. По словам старожилов, её позже продали в Заречное. Эта церковь имела два престола: в честь Тихвинской иконы Божией Матери и Иоанна Милостивого. К началу XX века она обветшала, и владелец села В.Н. Поливанов решил возвести новую. Сруб для неё изготавливали прямо в лесу, и строительство заняло несколько лет, в результате чего в Акшуате временно стояли два храма рядом.

В начале XX века владыка Гурий посетил село, и в его отчёте упоминается, что в Акшуате были два деревянных храма: старый, двухэтажный, и новый, ещё не освящённый из-за отсутствия иконостаса и оконных решёток. Старый храм находился в запущенном состоянии, с грязными стенами и провисшими картонными листами. Пол в алтаре был расшатан, а престол колебался.

Владыка обратил внимание на картину «Явление Марии Магдалины» работы профессора Худякова, бывшего крепостного Поливановых, а также на икону Спаса Нерукотворного, также написанную им. Во время освящения воды с клироса доносилось нестройное и крикливое пение, так как некоторые прихожане были нетрезвы. Священник объяснил это тем, что пьянство было распространённым пороком среди прихожан. Владыка Гурий в своём обращении к ним указал на убогость и ветхость храма и призвал избегать пьянства, которое ведёт к материальному и духовному упадку.

На церковном дворе хоронили священнослужителей. В начале 1960-х годов, когда церковь уже была закрыта и использовалась как зерносклад, лошадь провалилась в один из склепов, где нашли останки священнослужителя и несколько предметов, которые позже отнесли в школу. В конце 1950-х годов церковь использовали как колхозный амбар, и перед ней построили весовую. Внутри церкви было так пыльно, что иконы и росписи на стенах и куполе были едва видны.

В 1968 году церковь снесли. Очевидцы рассказывали, что её пытались свалить тракторами, но в итоге разобрали по частям. Позже на этом месте построили магазин. Говорят, что после разрушения церкви иконы использовали вместо мостиков через речку, а некоторые местные жители спрятали святые образы.

Сейчас в селе строится новая церковь благодаря инициативе группы пенсионеров, поддержанной главой МО «Барышский район» С.В. Кочетковым. Он помог снести старое здание магазина, стоявшее на месте церкви. Летом 2013 года настоятель восстанавливающегося храма, протоиерей Алексей Есин, освятил территорию для новой церкви.