Храм, посвященный Страстям Господним, малоизвестен среди жителей города из-за гонений на Церковь в советское время, хотя его история тесно связана с историей Саратова. Еще до Петра I на месте современного перекрестка улиц Московской и Октябрьской, который тогда находился за пределами крепости, была построена часовня. Точная дата ее постройки неизвестна, но первое упоминание о ней датируется апрелем 1696 года.

В 1827 году деревянная часовня была перестроена в каменную церковь и освящена. В 1860 году, после очередной перестройки для расширения, церковь была освящена в честь Страстей Господних, а в 1866 году в ней появился придел в честь Иверской иконы Божией Матери. Поскольку церковь была приписана к Спасо-Преображенскому мужскому монастырю и в ней служили монахи, в народе ее называли Киновией, что с древнегреческого переводится как «общежитие».

К середине XIX века храм оказался в центре Саратова. Он был богато украшен благодаря благотворителям: дорогая утварь, священные облачения, иконы в сребропозлащенных окладах. Хотя колокольни у храма не было, восемь колоколов, самый большой из которых весил около 690 кг, висели на специальных столбах с южной стороны здания.

После революции 1917 года церковь и подворье закрыли, здания перестроили и разделили, а затем здесь разместился Дом Народного Творчества. Позже в здании находилась Саратовская студия «Союзкинохроника», а после войны, «Нижне-Волжская студия кинохроники».

В начале 1990-х годов, из-за сложной экономической ситуации в стране, студия сократила выпуск кинопродукции, а в 2002 году началась ее приватизация. Помещения сдавались в аренду.

В 2012 году здание храма Страстей Господних вернули Саратовской епархии. 29 июля 2012 года в храме прошла первая Божественная литургия. В конце того же года начались масштабные ремонтно-восстановительные работы.

С июня 2014 года в храме возобновились богослужения. Каждое воскресенье в 10:00 проходят Евангельские чтения, на которых разбирается глава из Евангелия.

Из-за начала масштабной реконструкции храма, по благословению Митрополита Саратовского и Вольского Лонгина, в соседнем здании был оборудован временный храм. 10 марта 2017 года благочинный Троицкого округа священник Николай Генсицкий, вместе с настоятелем храма и духовенством благочиния, совершил Чин положения Антиминса во временном храме, после чего была проведена Литургия Преждеосвященных Даров.