В начале XVII века деревни находились во владении В. Головцына. Когда его дочь Анна Васильевна вышла замуж за В. А. Нащокина, потомка известного воеводы и дипломата А. Л. Ордын-Нащокина, Шишкино перешло к нему в качестве приданого. В. А. Нащокин, участвовавший в войне России с Турцией, был приближен к царскому двору. Когда у него родился сын, планировалось назвать его Дормидонтом. Однако императрица Елизавета Петровна согласилась стать крестной и дала ему имя Воин, в честь предка, дипломата Воина Афанасьевича Ордын-Нащокина, сына Афанасия Лаврентьевича. В. А. Нащокин оставил биографические записки, которые были опубликованы в 1845 году. Рядом с Шишкином в старину стояла деревянная Спасо-Преображенская церковь, а в 1749 году на ее месте возвели каменную, после чего село стало называться Новопреображенским.