Этот храм, ныне не существующий, располагался неподалеку от Спасо-Преображенского монастыря на пересечении улиц Эспланадной и Смоленской. Его история начинается в XVII веке, когда территория Белого города стала превращаться в густонаселённый посад. В то время как западная часть города была центром торговли, а центральная и южная, местом проживания стрельцов, северо-восточная часть оставалась малозаселённой. Лишь в начале 1670-х годов здесь, между Спасо-Преображенским и Вознесенским монастырями, появилась слобода рыбаков. Это место было удобно расположено рядом с Косыми, или Исадными, воротами Белого города, которые выходили прямо на судоходную реку Кутум. Вдоль её берега располагался астраханский рынок Исады, где рыбаки могли сразу продавать свой улов. Слобода развивалась и процветала. Вскоре после её основания появились первые упоминания о Смоленской церкви, связанной с новым приходом, в который вошли жители слободы. Возможно, именно они и построили первую деревянную церковь.

Храм был назван в честь иконы Божией Матери Смоленской, известной как «Одигитрия» или «Путеводительница». Эта икона покровительствовала путешествующим и рыбакам, которые доверяли себя её защите. Появление храма могло быть связано с прибытием в Астрахань списка чудотворной Смоленской иконы Божией Матери. Хотя точная дата появления этого списка неизвестна, он с первых дней хранился в храме как великая святыня.

В 1728 году астраханский купец Фёдор Черпаков обратился к епископу Варлааму Леницкому с просьбой разрешить строительство новой каменной Смоленской церкви. 19 января 1728 года он получил храмоздательную грамоту, и к 1737 году строительство было завершено.

10 ноября 1737 года епископ Иларион освятил новопостроенный храм.

В 1923 году Смоленская церковь была захвачена обновленцами. В 1928 году на заседании Президиума окрисполкома было принято решение о закрытии церкви на улице Трусова, 60. Здание признали обветшавшим и требующим значительного ремонта. Поскольку община обновленцев не имела средств на ремонт и содержание, церковь была закрыта, а её имущество передано в Госфонд. 5 января 1930 года здание бывшей Смоленской церкви было продано под снос. В том же году храм снесли. Сейчас на этом месте стоит двухэтажный жилой дом на углу улиц Трусова и Шелгунова, 30/10.