В 1842 году в селе Подгородняя Покровка был открыт молитвенный дом. К 1861 году, когда население села насчитывало 556 человек и 91 двор, было получено разрешение на строительство деревянной церкви на каменном фундаменте. Освящение церкви в честь Покрова Пресвятой Богородицы состоялось 29 сентября 1863 года.

В 1888 году рядом с храмом на средства местных жителей была построена церковно-приходская школа, рассчитанная на четыре класса.

В 1910 году храм был перестроен, и 24 октября епископ Челябинский Дионисий торжественно его освятил.

С 1930 года церковь оставалась бездействующей. Богослужения проводились нерегулярно, в основном на главные праздники, когда приезжал священник из города. Последняя служба состоялась на Пасху 1935 года, а в августе того же года здание церкви было передано под зернохранилище местного колхоза. В 1948 году здание стало собственностью лесозащитной станции, а затем его использовали как мастерские машинно-тракторной станции. Для въезда техники в алтарной стене и со стороны колокольни прорубили ворота, деревянный пол заменили на цементный, а деревянная обшивка была снята до карниза. Позже здание перешло в распоряжение местного техникума.

В 1991 году храм был возвращен верующим, и начались сложные восстановительные работы. Проломы в стенах заложили шпалами, пропитанными креозотом, построили колокольню и приобрели колокола. Стены обшили виниловым блокхаусом, а деревянные окна заменили на пластиковые.